定量PCR仪主要由两部分组成，一个是PCR系统，一个是荧光检测系统。市面上不同品牌和设计的定量PCR仪也不断推陈出新，这里着重介绍3类不同的定量PCR仪。
1.传统孔板式定量PCR仪
传统孔板式定量PCR仪的优点是可容纳的样本量大而且无需特殊耗材，可以采用传统的96孔板甚至384孔板进行批量的定量反应，但是缺点也显而易见-温度均一性不佳—平板固定加热模块的PCR温度控制有边缘效应—样品槽上每个孔之间的温度存在差异—也就是所谓位置效应，因此标准曲线的反应条件应难以做到与样本*一致，样本和样本之间的温度控制也可能存在差异，对于灵敏度*的定量PCR来说，任何极微小的差异都会以指数级别的规模被放大，不能不说是一种缺憾。传统反应板面积大，温度控制的性、升降温速度也相对较慢，因而反应速度也较慢。
2.离心式定量PCR仪
为了克服平板式定量pcr温度均一性差的缺点，聪明的研究人员又开发出创新概念的离心式实时定量pcr仪，pcr扩增样品槽被巧妙地设计为离心转子的模样，借助空气加热和转子在腔内旋转，转子上每个孔都是“等位”的，几乎无差别，很好的解决了每个样品孔之间的温度均一性的关键问题。样品间温度差异小于±0.01℃，大程度地保障了标准曲线和样品之间条件的一致性。利用空气做加热介质的优点在于能实现与反应体系无缝接触，接触面积大且加热均匀。
3.荧光定量PCR仪
对于国内的用户来说比较新鲜，机型小巧，只有16个样品槽，它的独到之处在于这16个样品槽分别拥有独立的智能升降温模块，也就是说这16个样品槽相当于16台独立的定量pcr仪！独立控温的好处首先是，你可以在同一定量pcr仪上分别进行不同条件的定量pcr反应，更为灵活自定义的梯度优化反应也好，或者是*不同的几组反应。对于实验室，荧光定量pcr仪使用频率可以被大化，实验人员都不用等待！允许不同条件pcr同时进行的定量pcr仪拥有*的优点，是其它任何平板式或者离心式定量pcr都不具备的。
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